La RUPI está liderada por un Comité Ejecutivo, integrado por algunos/as representantes de las Universidades integrantes.
Este comité está conformado de un/a coordinador/a General, un subcoordinador/a y tres coordinadores/as territoriales para el área norte, centro y sur del país.

Por acuerdo de la RUPI, cada Comité Ejecutivo cumple sus funciones en un ciclo de dos años.

Beatriz Aguirre

Coordinadora General 

Universidad Santo Tomás

Patricia Arteaga

Sub Coordinadora General

Universidad del Bío-Bío

Sara Salum

Coordinadora Zona Centro

Universidad de Valparaiso

Ricardo Espinoza

Coordinador Zona Norte

Universidad Católica del Norte

Aracelli Parada

Coordinadora Zona Sur

Universidad de Magallanes

Isaac Ravetllat

Consejero

Universidad de Talca